因为他的父亲明宪宗朱见深十分宠幸万贵妃，而万贵年纪已大，在和明宪宗生了一子夭折后，再也生不出孩子了，所以万贵妃非常忌妒后宫中所有怀孕生子的妃子，凡是有妃子怀孕她一定要将她们以及她们的孩子谋害掉，所以当明孝宗的生母纪氏在冷宫中生下他后，非常有善心的张敏公公就只能偷偷地将他抚养大。

朱见深的父亲明英宗朱祁镇因为“土木堡之变”被瓦刺人俘虏，当时的朱见深只有两岁，为了国家大局着想，孙太后同意朱祁镇的弟弟明代宗朱祁钰登基称帝，但是有一个要求，就是太子之位必须是朱见深的，但是朱祁钰在做了几年帝王后，想立自己的儿子为太子，不但废掉了朱见深的太子之位，而且将被瓦刺释放归来的朱祁镇和朱见深全部圈禁了起来。

为了让幼小的朱见深好过一点，孙太后将自己的贴身宫女万贞儿派去照顾朱见深，在那个危机四伏的漫长岁月里，万贞儿将朱见深照顾的非常周全，所以朱见深对万贞儿也有着深深的依赖，以至于父亲重新夺得皇位，自己又被立为太子登基后，他不顾后宫佳丽三千，只一心想与万贞儿到白头。

35岁的万贞儿嫁给了18岁的朱见深，婚后两年生下一子，朱见深立马表态要立此子为太子，但非常不幸的是，小皇子过早的夭折了，而此时的万贵妃年纪已大，再也生不出儿子，此后失去爱子的万贵妃性情大变，后宫中凡是有生育或是怀孕的妃子以及公主皇子们全部被她谋害。

而明孝宗朱佑樘的生母纪氏就是一次偶然的机会承宠了一次，就怀上了龙胎，万贵妃知道后将她打入冷宫，并派宫女将她谋害掉，但是因为此宫女很同情纪氏，就瞒过万贵妃偷偷放过了纪氏，纪氏在冷宫中生下儿子后不久死去，而孝宗身边的张敏公公看到这个幼小的孩子后，动了恻隐之心，将他偷偷藏了起来，并多次机智地躲过万贵妃的搜查。

就这样，太监将朱佑樘偷偷养到六岁，直到宪宗一次喊叹自己无子，张敏才敢将实情告之，朱佑樘重见天日了，但张敏却被迫服毒自杀，因为自己幼年的这一段经历，朱佑樘继位后，只娶了一任皇后，再不肯立妃，成了明朝最专情的君王。