民国六年,北洋政府爆发府院之争,直接导致张勋拥立溥仪复辟,共和体制再遭践踏。唐继尧等即申明主旨,联合各省组建靖国联军进行护法,唐继尧自任联军总司令,于是年十月将云南督军印务交刘祖武代理后统军北上。
为保证后方安全,唐继尧在出师之际,将云南划分为三个卫戍防区,分兵留守,各置卫戍司令一员统辖防务。其中第一卫戍司令驻防大理,卫戍滇西一带,先后以孙永安等出任司令;第二卫戍司令驻防蒙自,卫戍滇南一带,先后以缪嘉寿等出任司令;第三卫戍司令驻防昆明,卫戍省会及滇东地区,以唐继虞任司令。
卫戍司令部组织与滇军师一级建制大同小异,其所辖兵力则视辖地广狭、难易而定,各二三团不等,分任捍卫绥靖之责。同时代表督军节制、调遣辖区内宪兵、游击队、乡团、警察等一切武装及县知事以下行政官员。
下图即当时由云南督军公署下发《云南陆军卫戍暂行条例》局部内容:
民国九年秋,顾品珍率驻川滇军回省,唐继尧被迫辞职赴港,临行前,将各卫戍区驻军南调广西等处,以图反攻,靖国时期云南卫戍防务历史终结